Зоопарку принадлежит почти гектар территории, расположенной в границах улиц Шота Руставели, Брамса и Носова. До последнего времени территория, когда-то по неизвестным причинам отделенная от основной части зоопарка забором и впоследствии построенным мостовым переходом, была заброшена и зоопарком не использовалась. 

В 2019-2023 годах, в рамках проекта «Ольштынек - Калининград - от общей истории к будущему партнёрству» - победителя грантового конкурса Программы приграничного сотрудничества Россия-Польша 2014-2020, эта территория была благоустроена, там появился сквер «Зоологический», в котором создан мини-маршрут, рассказывающий о музее под открытым небом, когда-то там располагавшемся. Подробнее об этом можно прочитать здесь.

Однако в будущем зоопарк планирует построить в этой части комплекс вольер для животных Сибири и Дальнего Востока. «Изюминкой» проекта станет новый мостовой переход над ущельем ручья, выполненный в виде вагонов поезда «Москва – Владивосток».